![\"\"](\"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/wp-content\/uploads\/2026\/08\/Ensamble.png\")
Autores; H\u00e9ctor Fabio Espitia Navarro; \u00c1lvaro Jairo Pazos Moncayo<\/p>\nAutores; H\u00e9ctor Fabio Espitia Navarro; \u00c1lvaro Jairo Pazos Moncayo<\/p>\n
La secuenciaci\u00f3n de genomas bacterianos completos se ha consolidado como una herramienta fundamental en microbiolog\u00eda moderna y epidemiolog\u00eda molecular. Los datos de secuenciaci\u00f3n de nueva generaci\u00f3n requieren procesamiento bioinform\u00e1tico especializado para transformar millones de lecturas cortas en genomas ensamblados y funcionalmente anotados. En este contexto, las habilidades en bioinform\u00e1tica representan actualmente una necesidad imperativa en el mundo competitivo de las ciencias biol\u00f3gicas, que se apoyan cada vez m\u00e1s en an\u00e1lisis computacionales avanzados. Esta obra surge precisamente para responder a esta necesidad, proporcionando un flujo de trabajo completo, accesible y reproducible para generar genomas bacterianos de calidad apropiada desde datos de secuenciaci\u00f3n Ilumina.<\/p>\n
Utilizando cuatro genomas de Helicobacter pylori como caso de estudio, el libro gu\u00eda al lector a trav\u00e9s de ocho cap\u00edtulos principales: (1) preparaci\u00f3n del entorno computacional con Conda\/Mamba, (2) obtenci\u00f3n de datos desde repositorios p\u00fablicos usando SRA Tools, (3) control de calidad ylimpieza con FastQC y fastp, (4) ensamblaje de novo con SPAdes, (5) evaluaci\u00f3n integral mediante QUAST, BUSCO y an\u00e1lisis de k-meros, (6) anotaci\u00f3n funcional con Prokka, (7) plataformas web alternativas, y (8) conclusiones. Ap\u00e9ndices especializados complementan el contenido principal con gu\u00edas de resoluci\u00f3n de problemas, comparaci\u00f3n de ensambladores alternativos, y recursos avanzados.<\/p>\n
El enfoque metodol\u00f3gico combina fundamentos te\u00f3ricos con implementaci\u00f3n pr\u00e1ctica, utilizando comandos espec\u00edficos, interpretaci\u00f3n detallada de resultados y buenas pr\u00e1cticas en bioinform\u00e1tica. Todos los scripts y configuraciones est\u00e1n disponibles p\u00fablicamente en GitHub, garantizando la reproducibilidad completa del flujo de trabajo.<\/p>\n
Este libro est\u00e1 dirigido especialmente a estudiantes e investigadores en los campos de la biolog\u00eda y la microbiolog\u00eda que poseen conocimientos b\u00e1sicos de Linux y buscan desarrollar competencias pr\u00e1cticas en bioinform\u00e1tica gen\u00f3mica. La metodolog\u00eda presentada es directamente aplicable en contextos de investigaci\u00f3n b\u00e1sica, vigilancia epidemiol\u00f3gica y an\u00e1lisis de gen\u00f3mica comparativa, brindando herramientas vers\u00e1tiles para diversos escenarios profesionales y acad\u00e9micos.<\/p>\n
Tama\u00f1o:\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0Formato:\u00a0 Digital\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0Paginas: 152<\/p>\n
A\u00f1o:\u00a0 2026\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0ISBN:\u00a0 \u00a0 978-628-7864-38-2\u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0 \u00a0Valor:\u00a0 Descarga Gratuita<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Autores; H\u00e9ctor Fabio Espitia Navarro; \u00c1lvaro Jairo Pazos Moncayo La secuenciaci\u00f3n de genomas bacterianos completos se ha consolidado como una herramienta fundamental en microbiolog\u00eda moderna y epidemiolog\u00eda molecular. Los datos de secuenciaci\u00f3n de nueva generaci\u00f3n requieren procesamiento bioinform\u00e1tico especializado para transformar millones de lecturas cortas en genomas ensamblados y funcionalmente anotados. En este contexto, las […]<\/p>\n","protected":false},"author":4,"featured_media":10316,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_et_pb_use_builder":"","_et_pb_old_content":"","_et_gb_content_width":"","footnotes":""},"categories":[83,1],"tags":[],"class_list":["post-10314","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-83","category-sin-categoria"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/10314","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/4"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=10314"}],"version-history":[{"count":12,"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/10314\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10327,"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/10314\/revisions\/10327"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/10316"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=10314"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=10314"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/editorial.udenar.edu.co\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=10314"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}